برای ثبت بیماری نشاندار همانند نسخه‌های دیگر با واردکردن کد ملی بیمار وارد صفحه ثبت نسخه شده و با زدن کلید «بیماری نشاندار» در بالای پنل انواع نسخه، پنل بیماری نشاندار باز شده و پزشک می‌تواند یک بیماری را انتخاب و به لیست اضافه نماید.

• لازم به ذکر است دقت در ثبت صحیح بیماری حائز اهمیت بوده و در برخی موارد (مانند اوتیسم و ناباروری) امکان حذف بیماری وجود ندارد.